Введение:
Муковисцидоз обусловлен мутациями гена CFTR, кодирующего трансмембранный белок, формирующий хлорный канал в мембранах эпителиальных клеток. На сегодняшний день описано более 1800 мутаций гена CFTR, ответственных за развитие симптомов данного заболевания. К частым мутациям в мировой популяции относят 10 мутаций: F508del – 66%, G542X – 2,56%, G551D – 1,64%, N1303K - 1,61%, W1282X – 1,61%, 621+1G-T – 0,91%, R553X – 0,77%, 171-1G-A – 0,77%, 3849+10C-T – 0,58%, R117H – 0,55%. Остальные мутации суммарно составляют 23,47% от всех обследованных мутантных аллелей гена CFTR. Распределение и частота мутаций гена CFTR значительно различаются в разных странах и этнических группах. Относительные частоты некоторых мутаций, редких в мировой выборке МВ хромосом, могут достигать нескольких и более процентов в определенных регионах или этнических группах.
В результате ранее проведенных исследований было показано, что у больных МВ в России 25 мутаций локализованных в кодирующей части гена, охватывают до 70% всех аллелей гена CFTR, обширная перестройка, приводящая к делеции области гена со 2 по 3 экзоны, встречается в 5-7% мутантных хромосом. Таким образом, до 20% аллелей гена CFTR в России остаются неопределенными, что отличает популяцию России от большинства популяций Западной Европы, где выявлено более 95-98% мутантных аллелей гена CFTR, причем большинство изменений последовательности нуклеотидов содержатся в самих экзонах или их сплайсинг-сайтах, а обширные перестройки составляют не более 2% от общего числа мутаций.
Дальнейший поиск мутаций в гене CFTR является приоритетной задачей в случае России, поскольку в ряде случаев позволит уточнить диагноз, усовершенствовать подходы пренатальной диагностики, способствовать повышению качества медико-генетического консультирования и разработке методов лечения пациентов.
В исследовании будут использованы ДНК-пробы больных муковисцидозом, у которых найдена только одна мутация или ни одной в результате предшествующего скрининга частых мутаций в гене CFTR, проведенного в лаборатории генетической эпидемиологии ГФБУ МГНЦ РАМН.
1) Методом прямого секвенирования будет осуществлен поиск мутаций в кодирующей части гена CFTR, состоящей из 27 экзонов, включая области экзон-интронных.
2) Методом мультиплексного флуоресцентного ПЦР анализа (MLFP), позволяющего одновременно проводить количественную оценку нескольких экзонов гена, будет проведен поиск протяженных делеции-инсерций, детекция которых невозможна с помощью стандартных методов поиска мутаций.
Дальнейший поиск мутаций в гене CFTR является приоритетной задачей в случае России, поскольку в ряде случаев позволит уточнить диагноз, усовершенствовать подходы пренатальной диагностики, способствовать повышению качества медико-генетического консультирования и разработке методов лечения пациентов.
В исследовании будут использованы ДНК-пробы больных муковисцидозом, у которых найдена только одна мутация или ни одной в результате предшествующего скрининга частых мутаций в гене CFTR, проведенного в лаборатории генетической эпидемиологии ГФБУ МГНЦ РАМН.
1) Методом прямого секвенирования будет осуществлен поиск мутаций в кодирующей части гена CFTR, состоящей из 27 экзонов, включая области экзон-интронных.
2) Методом мультиплексного флуоресцентного ПЦР анализа (MLFP), позволяющего одновременно проводить количественную оценку нескольких экзонов гена, будет проведен поиск протяженных делеции-инсерций, детекция которых невозможна с помощью стандартных методов поиска мутаций.
