В апрельском номере журнала Pediatric Pulmonology Мэтью Фаут c соавторами из США опубликовали данные исследования, которые демонстрируют, что традиционный культуральный метод систематически недооценивает истинную грибковую нагрузку у пациентов с муковисцидозом.

Ученые применили технику секвенирования нового поколения (NGS) для анализа микобиома дыхательных путей в 76 образцах, полученных от 52 человек — как детей (бронхоальвеолярный лаваж и мазки из ротоглотки), так и взрослых (индуцированная мокрота). Результаты показали, что NGS обеспечивает идентификацию в 90% образцов, тогда как культуральный метод выявляет далеко не все присутствующие штаммы бактерий.

С практической точки зрения ключевым становится следующее: мазки из ротоглотки, вопреки ожиданиям, показывают сопоставимые данные с образцами из бронхоальвеолярного лаважа. Таким образом, у детей открывается возможность отказаться от инвазивной бронхоскопии в пользу неинвазивного взятия мазка.

Среди доминирующих видов, идентифицированных NGS, — Aspergillus (обнаружен во всех секвенированных образцах), Candida-Lodderomyces, Cladosporium и Agaricomycetes. Важно, что метод позволил выявить грибы, которые ранее не выявлялись при диагностике, что имеет прямое значение для назначения противогрибковой терапии и понимания триггеров бронхолегочного воспаления. Авторы резюмируют, что будущие исследования должны быть направлены на изучение грибково-бактериальных взаимодействий и их связи с клиническими исходами, однако уже сейчас NGS может считаться более чувствительным и информативным инструментом рутинной диагностики микобиома дыхательный путей при муковисцидозе.

Ссылка: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ppul.71598